Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms