Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms