Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms