Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms