Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms