Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms