Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms