Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LYSTQ99698 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms