Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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