Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms