Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM47Q96LD4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms