Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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SNX27Q96L92 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SNX27Q96L92 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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SNX27Q96L92 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SNX27Q96L92 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SNX27Q96L92 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SNX27Q96L92 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SNX27Q96L92 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SNX27Q96L92 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SNX27Q96L92 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SNX27Q96L92 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SNX27Q96L92 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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