Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ULK4Q96C45 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms