Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SPTSSAQ969W0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SPTSSAQ969W0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SPTSSAQ969W0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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