Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA6Q92908 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GATA6Q92908 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA6Q92908 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA6Q92908 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA6Q92908 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA6Q92908 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA6Q92908 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA6Q92908 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA6Q92908 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA6Q92908 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms