Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHIPQ8WWQ0 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms