Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms