Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELBQ8NG08 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELBQ8NG08 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms