Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SEMA6DQ8NFY4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SEMA6DQ8NFY4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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