Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDDC3Q8N4P3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDDC3Q8N4P3 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDDC3Q8N4P3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDDC3Q8N4P3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDDC3Q8N4P3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDDC3Q8N4P3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HDDC3Q8N4P3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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