Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms