Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RFPL4BQ6ZWI9 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms