Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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