Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms