Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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