Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms