Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF212Q495C1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179 ms