Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms