Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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