Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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