Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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