Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms