Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms