Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CBFBQ13951 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CBFBQ13951 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CBFBQ13951 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CBFBQ13951 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CBFBQ13951 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CBFBQ13951 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CBFBQ13951 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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