Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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