Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms