Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms