Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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