Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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