Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms