Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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STRN3Q13033 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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