Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FOXF1Q12946 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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FOXF1Q12946 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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FOXF1Q12946 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FOXF1Q12946 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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