Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNH2Q12809 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms