Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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