Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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