Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms