Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARDQ03181 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms