Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU5F1Q01860 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms