Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms