Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P62684 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms